公司采只采取指纹考勤的方式作为上下班记录（）

 王先生是武汉一家电子政务公司的客服专员，月工资2000元。公司的考勤采取电子打卡方式，上下班都要打卡，如有迟到早退的现象，当月要扣全勤奖，以及事假工资。公司客服人员经常要求加班加点，并且只按武汉市最低工资标准计发加班工资。王先生离职后，要求公司补足加班费的差额，被公司拒绝。于是，王先生向劳动争议仲裁委员会提起了仲裁请求，但公司否认安排王先生加班，克扣加班费的行为。仲裁委员会调解时，公司负责人认为，王先生加班应该拿出证据来，如果拿不出公司安排加班，少发加班费的证据，他的申请是无效的。王先生在协调无果的情况下，申请了法律援助，申请要求公司承担举证责任，提供考勤和工资发放记录等。请问员工讨要加班费时证据不足，如何申请经济补偿？

我们公司采用指纹考勤机进行上下班打卡，员工人数100人，考勤数据一月导出一次。现在问题是，根据导出的数据会有许多人员缺考勤记录，然后在和员工确认的过程中，有员工会说那天确实是来上班的，有部门同事、主管可作证，不知道为什么会没有记录，会不会是数据丢失了，或者是机器出故障了什么的，遇到此类情况该如何处理呢？